Uma Tokyo futurística, onde Ken , o protagonista de Ninja Blade, as lutas pelos direitos dos samurais japoneses comuns.
Ao contrário de Ninja Gaiden II, o arsenal do protagonista preenche todas as três armas, entre as quais você pode alternar em tempo real:
katana (ataque rápido, que pode se surpreender o inimigo)
Souken (espadas duplas, fácil de substituir nunchuck em batalha)
Taiken ( espada pesada, usada principalmente contra o inimigo com armadura pesada).
Ao longo dos anos, a capital do estado japonês tem sido repetidamente atacado inimigos. Parasitas Carriers, capaz de transformar em zumbis a cada criatura viva, agachou-se e espera nas asas. Répteis Pacify irritado com Ken e sua lâmina Fiel (armas tradicionais upgrade no local).